Fundado en 2008, el Instituto sintetiza las prácticas políticas y productivas de los movimientos latinoamericanos.
El Instituto Agroecológico Latinoamericano (IALA) Guaraní, se inserta dentro del proyecto de La Vía Campesina de construir una red de escuelas de Agroecología en América del Sur. Bajo esta perspectiva habían sido fundadas en un primer momento cuatro otras instituciones, entre ellas el IALA de Paraná (2005); el IALA Paulo Freire, en Venezuela (2006); el IALA Guaraní en Paraguay (2008) y el IALA Amazónico (2009).